MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 plasmid pET44827

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010813	AGC	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010813	CTTT	2	8	985	992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010813	CAGCT	2	10	1060	1069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010813	CAAC	2	8	1280	1287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010813	CGCCT	2	10	1322	1331	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_010813	GCC	2	6	1348	1353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010813	CCA	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010813	TGG	3	9	1603	1611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010813	GAC	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010813	AGG	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010813	ACC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010813	CTC	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010813	ACG	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010813	CGA	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010813	TCG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010813	CTC	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010813	G	6	6	4039	4044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010813	CGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010813	TGC	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010813	CTG	2	6	4116	4121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010813	CCCG	2	8	4178	4185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_010813	CTC	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010813	TTC	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010813	ACG	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010813	GTC	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010813	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010813	TGG	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010813	TCG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010813	CT	3	6	4555	4560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010813	ACG	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010813	GCG	2	6	4623	4628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010813	AGG	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010813	GCC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010813	CGA	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010813	GGCG	2	8	4692	4699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010813	TCG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010813	CG	3	6	4778	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010813	TGG	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010813	TCA	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010813	GC	3	6	4890	4895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010813	TCA	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010813	CGA	2	6	4940	4945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010813	TGC	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010813	CTT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010813	CTT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010813	CAG	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010813	GGCA	2	8	5094	5101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010813	CAC	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010813	GCCGT	2	10	5157	5166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010813	CCA	2	6	5187	5192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010813	CAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010813	TGC	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010813	GTG	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010813	GCCG	2	8	5317	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010813	CCG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010813	AGG	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010813	TCA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010813	TGC	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010813	CGT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010813	CGG	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010813	CA	3	6	5471	5476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010813	GCA	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010813	TGC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010813	CAT	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010813	TG	3	6	5582	5587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010813	GGA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010813	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010813	GCC	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010813	TCG	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010813	TGT	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010813	GGGC	2	8	5982	5989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010813	GA	3	6	6134	6139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010813	ACC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010813	CAC	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010813	GCC	2	6	6198	6203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010813	ACC	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010813	GTG	2	6	6322	6327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010813	TCA	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010813	TCC	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010813	ACC	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010813	ATG	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010813	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010813	ATT	2	6	6467	6472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010813	CGC	2	6	6517	6522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010813	GCA	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010813	GCA	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010813	AGG	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010813	GCA	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010813	CG	3	6	6873	6878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010813	CGT	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010813	GC	3	6	7177	7182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010813	GAC	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010813	CG	3	6	7199	7204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010813	CGA	2	6	7220	7225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010813	CAC	2	6	7245	7250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010813	GTG	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010813	CGC	2	6	7324	7329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010813	GTT	2	6	7372	7377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010813	CTAG	2	8	7419	7426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010813	AGC	2	6	7438	7443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010813	CCA	2	6	7508	7513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010813	TGG	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010813	ACTT	2	8	7567	7574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010813	GT	3	6	7605	7610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010813	TCT	2	6	7616	7621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010813	AGGT	2	8	7672	7679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010813	AAC	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010813	CCA	2	6	7809	7814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010813	AGTG	2	8	7854	7861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010813	CAC	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010813	AGC	2	6	9093	9098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010813	GCT	2	6	9107	9112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010813	GCT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010813	CTAA	2	8	9219	9226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010813	CCA	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010813	TCA	2	6	9275	9280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010813	TTCT	2	8	9326	9333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010813	TTA	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010813	CAAAA	2	10	9351	9360	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010813	AAC	2	6	9365	9370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010813	CTT	2	6	9423	9428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010813	GGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010813	ATA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010813	GCCC	2	8	9536	9543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_010813	TGG	2	6	9565	9570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010813	GGC	2	6	9579	9584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010813	T	6	6	9605	9610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010813	TTC	2	6	9639	9644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010813	CTA	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010813	TAG	2	6	9697	9702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010813	CGA	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010813	CTGC	2	8	9727	9734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010813	AGAA	2	8	9773	9780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010813	TCG	2	6	9802	9807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010813	TCA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010813	AAT	2	6	9891	9896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010813	CCA	2	6	9897	9902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010813	T	6	6	9907	9912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010813	TCT	2	6	9958	9963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010813	AAG	2	6	9971	9976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010813	TCA	2	6	10065	10070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010813	CAA	2	6	10186	10191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010813	ATT	2	6	10208	10213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010813	AC	4	8	10282	10289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010813	TG	4	8	10291	10298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010813	GCC	2	6	10362	10367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_010813	TGCC	2	8	10396	10403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010813	CCA	2	6	10515	10520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_010813	TCG	2	6	10574	10579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010813	TCCG	2	8	10642	10649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_010813	GC	3	6	10667	10672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010813	GC	3	6	10703	10708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010813	ACAA	2	8	10732	10739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010813	AC	3	6	10771	10776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_010813	AT	3	6	10786	10791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010813	T	6	6	14211	14216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010813	TCC	2	6	14228	14233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_010813	GAGT	2	8	18236	18243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010813	ACTG	2	8	19598	19605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010813	AAG	2	6	19613	19618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010813	ACAT	2	8	19632	19639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_010813	ATAA	2	8	19700	19707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010813	CG	3	6	20311	20316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_010813	TGC	2	6	20412	20417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_010813	CTG	2	6	20421	20426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_010813	TGA	2	6	20440	20445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010813	GTC	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_010813	TCGC	2	8	20475	20482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_010813	GGA	2	6	20533	20538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010813	CG	3	6	20596	20601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_010813	GCT	2	6	20717	20722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010813	ACA	2	6	20756	20761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_010813	GCT	2	6	20772	20777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_010813	CCA	2	6	20874	20879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_010813	CAG	2	6	20935	20940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_010813	TGA	2	6	20959	20964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010813	CG	3	6	20997	21002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_010813	AAGC	2	8	21003	21010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_010813	GC	3	6	21014	21019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_010813	ACC	2	6	21126	21131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_010813	CA	3	6	21136	21141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_010813	GCC	2	6	21176	21181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_010813	TGCC	2	8	21210	21217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
184	NC_010813	CCA	2	6	21328	21333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_010813	CAT	2	6	21657	21662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_010813	AC	3	6	21665	21670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_010813	TCC	2	6	21696	21701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_010813	TA	3	6	22574	22579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_010813	TA	3	6	22582	22587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_010813	TA	3	6	22598	22603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010813	TA	3	6	22606	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010813	GT	3	6	27179	27184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010813	CGC	2	6	27206	27211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
194	NC_010813	GTG	2	6	27286	27291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010813	GAA	2	6	27361	27366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_010813	GAA	2	6	27392	27397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010813	TCG	2	6	27543	27548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_010813	TCT	2	6	27596	27601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_010813	AGA	2	6	27625	27630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_010813	GGC	2	6	27698	27703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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224	NC_010813	CTC	2	6	28428	28433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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229	NC_010813	CAA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NC_010813	CA	3	6	28836	28841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
236	NC_010813	GC	3	6	28861	28866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
237	NC_010813	CAT	2	6	28896	28901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_010813	ACC	2	6	28942	28947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
239	NC_010813	CGGT	2	8	29000	29007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.